柯基纯品种有几种颜色？
犬类的毛色是由于皮肤中的毛囊的毛发色素造成的，毛囊中的黑色素细胞会产生两种色素：一种是黑色素，可出现黑色和棕色；另一种是 pheomelanin ，可出现黄色、红色和肝色。犬类毛色的遗传非常复杂，犬类的毛色基因位于1、4、10、12、X号染色体上。在毛色的遗传中除了显性和隐性基因外，还有一些基因对其他基因起修饰作用，还有的基因有互作效应，如肝基因只有在全色红的基础上才会发挥作用。柯基犬的毛发颜色有红、黑/白、蓝/白（肝色）等。
柯基犬中出现黑/白和蓝/白（肝色）需要两种基因B和A。B基因为黑色和棕色（肝色）控制基因，B为代表黑色，b为代表棕色；A基因控制毛发是否具有杂色，其对应的为a基因，a基因会导致毛发显现出毛囊外鞘的毛色，即毛发上的白底杂斑。只有基因型B-b和Aa柯基犬毛色才会同时具有黑色和白色；当出现出现B-b和aa的情况下，黑白分别出现，即白色斑特别少的黑色或肝色柯。当b-b和Aa时就会出现少量白杂色的肝色。
柯基犬红色（棕色）和红色黑斑（或称两色）的遗传规律更为复杂，除受上述B基因和A基因的控制外，还受MC1R 基因 、A、K、E、R、S、V和T 等基因的修饰。MC1R基因上的显性突变、S基因和部分的A基因都可导致柯基犬毛色呈现为红色。柯基犬红色毛发的毛囊外鞘也为红色，所以这些柯基犬身上不会有白色斑点。若出现红/黑斑（或称两色）则需要B和A两种基因的控制，即B-b和Aa基因，而黑色斑点的大小、形状和位置则受krt71基因影响。
在柯基犬的繁育中，纯合子的红、黑/白、蓝/白（肝色）都是重要的品系，而纯合子的红和黑/白则是两个最为重要的品系。纯红是 A- 品系，可以提供红色斑块，纯黑/白(A-)可以提供各种各样的白点，两者杂交获得的杂种红/黑斑柯基犬一般为双杂合子，具有极强的繁殖力。
由上可知柯基犬的毛色由多个常染色体基因控制，性染色体上基因也可能对毛色有作用，犬类中有两个性别连锁的白点，分别为西高地白梗和边境梗。